污染过程与生态效应 

 以长期污染、复合污染水土为主要对象，研究典型污染物在分子尺度上的赋存形态、界面行为、迁移规律，迁移动力学与规律、生态毒理与毒害。

污染控制与生态修复 

 以污灌区和工矿废弃地长期污染、复合污染土壤为主要对象，以生态治理为主要手段，研究污染物阻控与消减；生态修复原理与技术；废物处理与循环利用。

区域环境与环境管理

 以区域环境安全为主要目的，以典型城市和工业密集区为主要研究对象，研究区域环境质量演变规律；循环经济与产业生态；环境风险与灾害预警。