污染生态与环境工程实验室在上世纪70年代在国内率先开展了沈阳张士灌区土壤重金属、沈抚灌区石油烃及PAHs污染调查及污染防治研究,而后相继开展了污水土地处理、土壤环境重金属元素背景调查及环境容量,土壤-植物系统中有机、无机污染物的分布、形态转化、行为特性、生态毒理效应及污染土壤生态修复等方面的研究,在污染生态学学科建设与发展方面做出了重要的贡献,为我国土壤-植物系统的污染防控对策提供了科学依据。污染生态与环境工程实验室于2009年正式验收通过成为中国科学院重点实验室。实验室历时10余年的建设和发展,在课题申请与培育、领域拓宽、平台建设、人才培养与引进、团队建设与协作方面都取得了一定的成绩。